تاریخچه طبقه‌بندی آغازیان :
در دهه ۱۸۶۰ برای اولین بار فردی به نام ارنست هاینریش هاکل، پروتیست ها را تحت عنوان گروهی مستقل از جانداران طبقه بندی کرد. در اوایل کشف پروتیست ها گمان می شد که این جانداران از شکل های اولیه گیاهان و جانوران هستند. با گذشت زمان و پیشرفت دانشمندان در علم ژنتیک مولکولی، درک تفاوت ها، شباهت ها و روابط بین ارگانیسم های مختلف آسان تر شده و منجر به طبقه بندی جداگانه پروتیست ها به عنوان یک فرمانرو در بین یوکاریوت ها شد. البته هنوز هم طبقه بندی آغازیان یکی از موضاعتی است که تحقیق روی آن ادامه دارد، مثلا طبقه بندی این جانداران از نظر بیوشیمی یا زیر ساخت از معیار های طبقه بندی هستند.
